אגף הארגון באמונה מרכז את כל הפעילות התורנית, התרבותית והחברתית בסניפים. 26 סניפים בכל רחבי הארץ מהווים את התשתית הארגונית והדינאמית של העבודה הקהילתית והקשר עם החברות. סביב הציר המרכזי הזה נעים אלפי מתנדבות ומתנדבים, הפועלים בתחומים שונים של חסד ונדיבות ומעשים טובים; ניהול מסעדה לאנשי גיל הזהב, ביקורי חולים, חלוקת מנות קמחא דפסחא ומשלוחי מנות לפורים, מוקדי סיוע להיכרויות אמינות בין צעירות לצעירים, הדרכה וסיוע בקליטת עולים חדשים, הפעלת מועדוניות וחוגי תרבות וספורט ועוד.
פרט להפעלתם של המתנדבים, מתקיימת בסניפים, על בסיס יומי, פעילות סדירה של לימוד, הרצאות, ימי עיון, ערבי שירה וחוגי תרבות, אמנות והתעמלות וכן סיורים וטיולים מודרכים ברחבי הארץ.