בתי הילדים של אמונה ממלאים את אחת מן המצוות והמשימות החברתיות החשובות בימינו, ברוח המאמר התלמודי במסכת סנהדרין: “כל המקיים נפש אחת מישראל, מעלה עליו הכתוב כאילו קיים עולם מלא”. היעד המרכזי הוא לשמש לחניכים – המופנים ברובם על-ידי שירותי הרווחה ובתי המשפט – בית חם, ולהעניק להם סביבה משפחתית תומכת. כפרי הנוער של אמונה נמצאים בבני-ברק, בנתניה, בפרדס-חנה, בעפולה ובאבן שמואל והילדים משובצים ומשולבים בבתי הספר האזוריים.
בכל אחד מהם פועלים, סביב השעון, צוותים מקצועיים מן המעלה הראשונה – ובהם פסיכולוגים ועובדים סוציאליים, רופאים ופיסיותרפיסטים, קלינאי תקשורת, מורים ומדריכים. כל אחד מהם מיישם שיטות טיפול חדשניות, מפעיל מרכזי למידה וקבוצות טיפול להורים ומקיים מערכות תמיכה – באמצעות ספורט, מוסיקה, אמנות, יצירה, תרפיה ורכיבה ועוד – כדי לחשל ולחזק את הנערות והנערים ולחלצם ממעגל המצוקה והסיכון.